DNAMAN 9破解版(附激活教程) 生物綜合序列分析軟件

DNAMAN 9破解版是一款功能強大的生物綜合序列分析軟件，該軟件能夠滿足您擴增模板DNA要求的PCR引物，而且從文本文件導入寡核苷酸序列是將大量oligo記錄添加到數(shù)據庫的便捷工具。另外DNAMAN使用序列通道將有效序列保存在計算機內存中。序列通道通過減少磁盤訪問時間來提高分析效率。因此小編在這里為大家準備了破解版，教程如下，有需要的趕緊來下載吧！

DNAMAN 9破解教程

1、下載軟件包解壓，雙擊“DNAMAN_setup.exe”程序安裝軟件，點擊next。

2、選擇I accept接受協(xié)議，點擊next。

3、選擇安裝位置，默認在C盤建議安裝在其他位置。

4、點擊install安裝軟件。

5、正在安裝軟件，請稍等。

6、安裝完成，取消勾選，點擊finish。

7、安裝完成后，運行“patch.exe”漢化破解補丁，點擊下一步。

8、點擊完成，將彈出窗口開始注冊軟件。

9、點擊開始注冊軟件。

10、漢化補丁注冊成功，漢化破解完成。

11、運行桌面快捷方式，如果還是顯示需要填寫序列號，任意輸入數(shù)字即可破解。

注意：為避免升級后程序界面變回英文，已禁用程序升級功能;如果您要升級程序，只需將目錄下的LBUpdate.dll重命名為LBUpdate.exe 后運行即可。

軟件功能

兩個引物互補

您可以使用DNAMAN檢查兩個寡核苷酸序列的互補性。 要執(zhí)行此功能，第二個引物應通過選擇引物|載入DNAMAN存儲器 兩個Primer互補命令。

DNAMAN搜索兩個引物之間的互補序列。 結果表明兩個引物之間的連續(xù)和不連續(xù)的互補序列。

PCR引物設計

您可以使用DNAMAN選擇滿足您擴增模板DNA要求的PCR引物。 設計了許多參數(shù)來篩選PCR引物，例如PCR產物大小，引物長度，Tm，GC組成和鹽濃度的范圍。 其他參數(shù)用于排除“低質量”引物。

導入和導出記錄

從文本文件導入記錄

從文本文件導入寡核苷酸序列是將大量oligo記錄添加到數(shù)據庫的便捷工具。

DNAMAN將記錄的信息列入七個字段：名稱，來源，備注，長度，GC含量，熔解溫度和序列。如果數(shù)據庫中有大量記錄，則可以使用前四個字段作為排序鍵，以便在“記錄列表”框中選擇性地顯示記錄。

導向不匹配

定向錯配可以通過在突變附近的位點引入單次或雙重錯配來創(chuàng)建或去除當前DNA序列或其變體上的限制性位點。 使用此功能，您可以創(chuàng)建或破壞限制性位點，以區(qū)分野生型等位基因與常見突變體等位基因。

軟件特色

1、DNA和蛋白質序列編輯

2、DNA序列轉化

3、多序列比對，對齊編輯和分析

4、系統(tǒng)樹分析

5、DNA或蛋白質序列的點陣比較

6、DNA序列組裝和編輯

7、BLAST通過網絡界面在Intranet / Internet Server上進行搜索

8、序列和數(shù)據庫中的增強型圖案搜索

9、SiRNA選擇器

10、限制分析

11、繪制序列圖與出版品質

12、限制模式預測

13、電子克隆

14、從限制片段重建限制圖

15、靜音突變分析創(chuàng)建/破壞限制性位點

16、導向不匹配以創(chuàng)建/破壞限制站點

17、翻譯和密碼子使用分析

18、蛋白質疏水性/親水性分析

19、蛋白質表征：等電點的序列組成和預測

20、蛋白質二級結構預測

21、反向翻譯

22、PCR和測序引物的設計

23、表征DNA或引物序列的熱力學性質

24、分歧分析

25、管理寡核苷酸，DNA和蛋白質數(shù)據庫

26、生成隨機序列

詳細介紹

序列通道

DNAMAN使用序列通道將有效序列保存在計算機內存中。序列通道通過減少磁盤訪問時間來提高分析效率。序列加載到序列通道后，您可以執(zhí)行許多功能分析，如限制性分析，翻譯分析，序列搜索和比較以及PCR引物設計。在DNAMAN中有20個通道，它們中的任何一個都可以被選作默認序列通道。默認順序是您當前正在處理的順序。單擊序列通道欄上的數(shù)字將默認激活相應的通道。

DNA和蛋白質序列都可以加載到通道中。 DNAMAN檢查序列的組成以確定其是DNA還是蛋白質片段。 DNA序列自動加載到通道中。蛋白質序列將被用戶確認，而DNA序列則不會。如果序列類型未正確定義，您可以使用分析定義功能更改序列類型。信息/序列欄中可以顯示默認頻道中的序列。

菜單

DNAMAN有九個主菜單顯示在屏幕上方。每個主菜單都有幾個菜單，其中一些菜單有子菜單。執(zhí)行功能的命令被描述為主菜單|菜單|子菜單。

例：

a)選擇File | Open命令打開一個DNAMAN文件。

b)選擇序列|加載順序|從數(shù)據庫命令將數(shù)據庫中的序列記錄加載到默認序列通道中。

工具欄

該工具欄設計用于最常用的菜單命令，并允許用戶輕松訪問它們。您可以使用Info |中的命令顯示或隱藏工具欄查看工具欄菜單。

文件

在DNAMAN中有七種文檔類型。

1)文本(序列)文件

序列文件是一般文本格式(文本文件)。文本文檔顯示在文本窗口中。 DNAMAN提供了一個用于序列編輯的標準文本編輯器。序列應保存為純文本文件，并將“.seq”擴展名添加到文件名中。

2)限制地圖文件

限制圖用于保存DNA圖(*。dmp)。 DNAMAN地圖文件是二進制格式并存儲限制地圖對象。 DMP文件只能用DNAMAN打開和編輯。您也可以將DMP文件作為圖形繪制對象復制到任何接受繪圖的其他程序。

3)點矩陣文檔

DNAMAN將二進制DMF文件中的點陣數(shù)據保存為無法作為文本文件打開。

4)多重對齊文件

DNAMAN以MSD(* .msd)格式保存多個序列文檔。 MSD文件采用文本格式，并帶有用于DNAMAN(MASED)的多重對齊編輯器的特殊關鍵字。您可以在MASED中加載MSD文件并執(zhí)行多個序列分析。如有必要，您也可以在文本編輯器中打開MSD文件。

5)序列組裝文件

序列組裝文檔以SAF格式(* .saf)保存。 SAF文件也是文本格式，帶有用于DNAMAN序列組裝編輯器的特殊關鍵字。裝配編輯器用于編輯和可視化重疊群。如有必要，您也可以在文本編輯器中打開SAF文件。

6)跟蹤文件文件

DNAMAN可用于查看和分析自動化DNA測序儀生成的色譜圖文件，例如ABI系列PE BioSystem。 DNAMAN可以打開ABI和SCF文件，也可以將編輯好的序列保存到這些文件中。

7)系統(tǒng)發(fā)育樹文件

DNAMAN以擴展名PTR保存文本格式的系統(tǒng)發(fā)育樹文件。系統(tǒng)發(fā)育樹文件可以作為文本打開或編輯。

狀態(tài)欄

狀態(tài)欄顯示在DNAMAN窗口的底部。 要顯示或隱藏狀態(tài)欄，請使用視圖菜單中的狀態(tài)欄命令。

狀態(tài)欄的左側區(qū)域描述了使用箭頭鍵瀏覽菜單時菜單項的操作。 此區(qū)域同樣顯示描述工具欄按鈕按下時的動作的消息，然后釋放它們。 如果在查看工具欄按鈕命令的描述后，希望不執(zhí)行該命令，則在指針離開工具欄按鈕時釋放鼠標按鈕。

狀態(tài)欄的右側區(qū)域表示下列哪個鍵被鎖定：

指標描述

CAP Caps Lock鍵鎖定。

NUM Num Lock鍵被鎖定。

SCRL Scroll Lock鍵鎖定。

工具欄

工具欄顯示在應用程序窗口的頂部，菜單欄下方。 該工具欄提供了對DNAMAN中使用的許多工具的快速鼠標訪問，

要隱藏或顯示工具欄，請單擊視圖菜單中的工具欄。

開始使用DNAMAN

了解DNAMAN

序列編輯

DNAMAN提供了一個文本編輯器來編輯序列文件。您可以添加或刪除文件中的任何文本或序列。您也可以使用復制和粘貼功能來編輯文件。一些序列分析結果也顯示為文本文件，因此可以使用編輯器編輯這些結果。當你打開一個序列文件時，序列可以直接加載到當前通道。如果自動加載選項關閉，分析功能不可立即使用。在分析之前，您必須手動將序列加載到通道中。

序列分析

您可以選擇一個序列并對其進行多種分析。該序列必須加載到序列通道中。 DNAMAN提供了20個序列通道來保存內存中的活動序列。您可以同時分析和比較通道中的所有序列。您可以在分析過程中將一個序列切換到另一個序列，而不必回到磁盤文件。

序列比對和比較

您可以直接使用磁盤文件進行多重對齊和序列組裝。沒有必要將這些序列加載到通道。要執(zhí)行這些任務，請在菜單欄上選擇相應的命令，選擇序列文件并填寫適當?shù)膮?shù)。 DNAMAN會記住這些分析中使用的文件。您可以重新分析這些序列而無需返回到磁盤文件。

快速啟動DNAMAN

如果您第一次使用DNAMAN，您可以按照下面的說明進行操作。

要執(zhí)行序列分析：

1)啟動DNAMAN。序列文件示例會自動打開，您可以轉到步驟3.否則，請選擇Sequence |加載順序|從序列文件菜單中。

2)從打開文件對話框中選擇Example1.Seq文件。單擊打開將Example1加載到序列通道1。

3)選擇限制|限制分析菜單對Example1執(zhí)行限制分析。

4)限制性分析后，選擇蛋白質|翻譯菜單將Example1翻譯成氨基酸序列。

要繪制沒有序列的限制圖：

選擇限制|繪制地圖菜單。質粒圖譜在限制圖窗口中繪制。雙擊窗口以顯示地圖屬性并進行修改。

提示：限制地圖中的所有對象都可以通過拖放來移動。限制網站和文本對象在被選中時可以對齊。

DNAman怎么分析序列的酶切位點

將待分析的序列裝入Channel,點擊要分析的Channel,然后通過Restriction/Analysis 命令打開對話框.

參數(shù)說明如下：

Results 分析結果顯示

其中包括：

Show summary(顯示概要) Show sites on sequence(在結果中顯示酶切位點)

Draw restriction map(顯示限制性酶切圖)Draw restriction pattern(顯示限制性酶切模式圖)

Ignore enzymes with more than(忽略大于某設定值的酶切位點)

Ignore enzymes with less than(忽略小于某設定值的酶切位點)

Target DNA (目標DNA 特性)

circular(環(huán)型DNA),dam/dcm methylation(dam/dcm 甲基化)

參數(shù)說明如下：

Enzyme

代表(enzyme data file),點擊旁邊的下拉按鈕,出現(xiàn)兩個默認選項,restrict.enz 和dnamane.enz,

如果添加過自制的酶列表,則附加顯示自制酶列表文件名.其中restrict.enz 數(shù)據文件包含180 種

限制酶,dnamane.enz 數(shù)據文件包含2524 種限制酶.選擇其中一個數(shù)據文件,相應的酶在左邊的 顯示框中列出(按酶名稱字母表順序),鼠標雙擊酶名稱,則對應的酶被選中,在右邊空白框中列 出.要自制酶切列表,可以從左邊酶列表中雙擊鼠標選擇多種酶(例如puc18 multiple cloning sites),然后點擊按鈕出現(xiàn)下列對話框：輸入要保存酶列表的文件名,點擊按鈕即可保存.自制酶列表可以方便分析特定的酶切位點.

Cutter 酶切識別序列長度;End 酶切產生的末端,其中包括,Blunt(平頭末端),5’Overhang

(5’突出粘性末端),3’Overhang(3’突出粘性末端),系統(tǒng)根據cutter 和end 的設定情況,在左邊酶列表 中顯示符合條件的酶.最后,點擊按鈕執(zhí)行操作.

如何使用DNAMAN軟件制作序列比對圖

圖1

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圖9

圖10