GSL Biotech SnapGene(分子生物學(xué)軟件) v6.2.1官方正式版分子生物學(xué)軟件

GSL Biotech SnapGene是一款專業(yè)的分子生物學(xué)軟件，這款軟件提供了設(shè)計引物，酶切位點(diǎn)，氨基酸翻譯，密碼子優(yōu)化，序列本地或者網(wǎng)上blast比對等功能。

基本簡介

SnapGene是一款功能強(qiáng)大的日常分子生物學(xué)軟件。使用旨在為用戶提供完善的計劃，可視化和記錄您的日常分子生物學(xué)程序的解決方案。擁有友好的用戶界面，可以方便，全面地記錄我們經(jīng)常生成的所有結(jié)構(gòu)?？稍赟napGene中完成所有克隆，并且優(yōu)化改善你的策略，快速創(chuàng)建質(zhì)粒圖譜，并提供優(yōu)雅，信息豐富的窗口，用于模擬各種常見的克隆和PCR方法。它節(jié)省了大量的時間和金錢，容易操作的可視化和模擬，提前預(yù)測可能發(fā)生的錯誤，并提醒用戶進(jìn)行改善，整個過程中，每一個操作都會自動記錄，這樣的話，用戶可以清楚準(zhǔn)確的看到你所有的操作內(nèi)容，并可以通過.dna文件與同事共享豐富的帶注釋的地圖和序列。

軟件特色

1.限制性站點(diǎn)指標(biāo)

確認(rèn)限制性網(wǎng)站適合克隆。獨(dú)特性，甲基化敏感性，特殊性質(zhì)以粗體顯示獨(dú)特的限制性位點(diǎn)，或選擇自動定義的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組，不要被愚弄，因為限制性位點(diǎn)被Dam，Dcm或EcoKI甲基化阻斷。SnapGene將自動用星號標(biāo)記該站點(diǎn)，利用工具提示來避免有問題的限制網(wǎng)站。

2.限制性克隆

可視化克隆過程的所有方面，如果您已經(jīng)考慮過程，則模擬只需幾秒鐘。如果克隆過程存在設(shè)計缺陷，則可以捕獲并糾正錯誤。

3.PCR

模擬標(biāo)準(zhǔn)PCR，使用您自己的引物，或要求SnapGene自動設(shè)計引物。產(chǎn)品文件在其歷史記錄中存儲模板和引物。

4.重疊延伸PCR

通過重疊延伸PCR融合片段，最多可組裝八個碎片。選擇要連接的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計引物。

5.引物定向誘變

使用誘變引物進(jìn)行定點(diǎn)誘變，選擇誘變引物，按下按鈕查看修飾的質(zhì)粒。歷史顏色突出了突變。

功能介紹

1.In-Fusion克隆:一種多用途、多用途的方法來創(chuàng)建無國界的基因連接。SnapGene是第一個模擬這種方法的軟件。只要選擇你想要混合的DNA片段，程序就會設(shè)計它。

2.Gibson Assembly:許多研究人員在不使用限制性酶的情況下將Gibson Assembly轉(zhuǎn)化為質(zhì)粒。通過PCR將DNA片段連接起來進(jìn)行干擾。

3.PCR及誘變:經(jīng)引物設(shè)計后，可用于常規(guī)PCR克隆、共PCR擴(kuò)增或誘變。得到的DNA序列文件可以立即進(jìn)行進(jìn)一步的操作。

4.自動文檔化:自動記錄模擬項目中的步驟。每次編輯或模擬序列時，此方法都會自動記錄在圖形歷史記錄中。在模擬DNA的結(jié)構(gòu)之后，您可以使用歷史作為實(shí)驗協(xié)議。

5.瓊脂糖凝膠電泳:使用先進(jìn)的算法創(chuàng)建逼真的瓊脂糖模擬。有限的部分顯示在三種模擬凝膠格式，數(shù)值列表和序列圖。您可以使用這種模擬凝膠來計劃診斷約束或?qū)D像與預(yù)測模式進(jìn)行比較。

使用步驟

視圖一：Map

直接打開任一質(zhì)粒圖譜(以pUC57為例)，點(diǎn)擊Map按鈕，得到如下界面：

顯示酶切位點(diǎn)。點(diǎn)擊該按鈕，得到如下界面。

顯示質(zhì)粒圖譜的開放閱讀框及轉(zhuǎn)錄方向。點(diǎn)擊該按鈕，得到如下界面：

顯示ORF的片段大小、GC%值等一些信息。點(diǎn)擊該按鈕，得到如下界面：

視圖二：Sequence

點(diǎn)擊Sequence按鈕，得到如下界面：

顯示編碼的氨基酸序列。點(diǎn)擊該按鈕可以切換氨基酸的全稱和縮寫。

點(diǎn)擊該按鈕，選擇All6 frames，可以得到所以所有序列編碼氨基酸的情況。

視圖三：Enzymes

點(diǎn)擊Enzymes按鈕，得到如下界面，可以看到不同酶切位點(diǎn)在序列中位置：

視圖四：Features

點(diǎn)擊Features按鈕，得到如下界面，顯示一些常用元件(含元件的位置、大小、功能等信息)